Selvom man grundlæggende er enige om, at al trolddom er kætteri og en afvigelse fra den kristne kirke, så handler landene i Europa meget forskelligt i selve hekseprocesserne.
I de skandinaviske og nordeuropæiske lande er det den protestantiske kirke, der dominerer og med opfattelsen af, at det kun er Gud, der kan give syndsforladelse og tilgivelse i det næste liv, straffes mange hekse med døden.
Sydpå er man fra slutningen af 1500-tallet mere skeptisk over for ideen om hekse. I de katolske lande, anses bodsgang og syndsforladelse derimod som en del af en proces hen mod genoptagelse af de trolddomsanklagede i kirken. Straffen ender derfor sjældent med dødsdom, men derimod med bøder, nadver, fængsling og pisk.
I den juridiske proces er der også store forskelle. I katolske lande føres sagerne primært i religiøse domstole, hvor inkvisitioner styre hele retssagen og selv fremfører anklagerne. Forhør og tortur benyttes, og tilståelser ses som endeligt bevis på trolddom.
Den Protestantiske kirke har slet ikke så meget magt i Nordeuropa, og sagerne føres uafhængigt af kirken. Her er tilståelser under tortur heller ikke nok – den anklagende part skal derimod kunne stille med beviser og vidner til den påståede trolddom.